Le MFPF est une organisation non gouvernementale (Association loi de 1901). Les associations départementales sont organisées en 20 fédérations régionales et en une confédération nationale. Un congrès trisannuel prend les décisions importantes. Le conseil d'administration est chargé de les appliquer. Le MFPF agit auprès des pouvoirs publics pour faire reconnaître les droits des femmes à la maîtrise de leur fécondité (contraception, avortement) et lutte pour l'élimination de la violence sexiste.